В неблагоприятных условиях среды многие прокариоты образуют споры. Спорообразование выражается в выделении нее большого участка цитоплазмы, содержащего кольцевидную хромосому, и окружений его толстой многослойной капсулой. Метаболизм внутри споры практически прекращается, спора обызвествляется. В сухом состоянии споры могут сохранять свою жизнеспособность сотни и тысячи лет. Попадая в благоприятные условия, спора «прорастает» и дает начало полноценной активной прокариотической клетке.